Da Matsukubo ble med Courage på lån i 2023, ville det vært vanskelig å forutsi hvor stor innvirkning 18-åringen ville ha. Det tok ikke lang tid før hun fikk en permanent kontrakt, og signerte en i 2024. Hun ble en viktig del av midtbanen, scoret i NWSL Challenge Cup 2023 og fikk MVP-utmerkelser.
I 2025 ble hun kåret til årets midtbanespiller i NWSL etter å ha spilt inn 11 mål og fire assists i løpet av sesongen.
Matsukubo spilte 58 opptredener i den ordinære sesongen, scoret 19 mål og la til 10 assists i løpet av sine tre år med Courage. Hun slutter seg til Chelsea FC på en femårskontrakt etter at klubbene ble enige om overgangen fredag.
